與高中職以下不同，大學生會隨課堂轉變或社團活動而有較複雜的接觸史，因此12校皆已在教育部指導下完成防疫小組編組及教育訓練。在防疫控管的部分，輔仁大學本次擔任北一區防疫示範學校，針對不同疫情等級的訪客管理機制及校園出入口的管控、居家檢疫的每日通報與後續關懷等、學校環境清潔（教室、實習場所、公共區域、餐廳等）一般或強化性的清潔與消毒，師生整體宣導與輔導、醫護相關科系的實習或一般實習場域因應不同疫情等級是否續辦或中止、學校與家長及實習機構的溝通，皆訂有規範。逢甲大學主要安排需要檢疫的學生住在校外（飯店），並由該校資訊處開發體溫自主管理系統，讓校外賃居生可以每天回報，現階段也計畫將這項體溫管理的實施對象擴展到所有教職員工生及訪客，除了體溫之外，比照成大系統將身體其他狀況如咳嗽等都納入紀錄。